构建自抗基因导向的产萜基因簇挖掘平台开题报告

1. 研究目的与意义（文献综述包含参考文献）

1.生物合成基因簇天然产物（natural products）nps，是由生物体以特殊方式产生的基因编码的小分子，其研究涉及分子结构、生物合成和生物活性1。

来自微生物的nps在工业、农业和生物医学应用中表现出极大的重要性2。

生物合成基因簇(biosynthetic gene clusters)bgc：由遗传分析表明，天然产物通常由一组基因合成，这些基因在空间上聚集在细菌基因组的某一位置。

2. 研究的基本内容、问题解决措施及方案

1 本课题要研究或解决的问题：基因簇里面的各个基因组分是如何相互协同作用，从而决定天然产物的？基因簇里面的是否有决定天然产物的关键基因组分？2 本课题拟采用的研究途径：1) 从card、mibig等数据库及相关文献收集抗性基因数据，构建靶向抗性筛查系统。

2) 从mibig及相关文献收集萜类合酶数据库，构建萜类合酶表征数据库。

3) 使用antismash等基因簇筛查工具，分析若干种（～100）放线菌的基因组数据，结合1、2两个数据库，筛查合成萜类产物等基因簇。