水稻ef2/南京11的F2群体抽穗期性状的QTL的分析开题报告

1. 研究目的与意义、国内外研究现状（文献综述）

1. 国内外研究背景 抽穗期是水稻重要农艺性状之一，对于水稻抽穗期相关基因的定位、克隆及作用机理等的研究一直都是备受关注的热点。

科学家们通过多年的努力，在水稻抽穗期的研究上已经取得了一些初步的进展。

1.1 水稻抽穗期的决定因素 1.1.1 感光性水稻作为典型的短日照作物，在短日照时开花期缩短，而在长日照下开花期则延长数天。

2. 研究的基本内容和问题

利用经EMS诱变的早抽日本晴突变体与NJ11的杂种F1自交得到F2，对F2群体进行抽穗期的调查并分单株提DNA,选取合适的SSR、Indel等标记通过聚丙烯酰胺凝胶电泳获得它们的基因型，利用QTL分析软件，看是否存在有效应的位点。

3. 研究的方法与方案

1.研究材料材料为经ems诱变的日本晴早花突变体，与野生型相比，表现出早花14天的表型。

2.研究方法 首先通过ems诱变获得了日本晴早花突变体，将日本晴突变体与nj11杂交得到的f1自交获得f2。

对f2群体进行抽穗期的调查并分单株提dna。

4. 研究创新点

本实验利用SSR、Indel引物对F₂群体的184个单株进行聚丙烯酰胺凝胶电泳，这些引物均匀分布在水稻12条染色体上，对F₂群体进行全基因组的扫描。

5. 研究计划与进展

2014年7月-10月，在土桥实验基地调查F2群体抽穗期，记录数据； 2014年10月，提取DNA； 2014年11月，筛多态，在12条染色体上分别选取适当的Indel或SSR等标记； 2014年11月-2015年1月，对随机选取的184个DNA进行聚丙烯酰胺凝胶电泳，获得其基因型； 2015年1月-2月，分析结果，对需要加密的位置继续选取合适标记加密，用相关软件进行分析，看是否存在具有较高效应的位点； 2015年3月，用回交一代的群体对有效应的位点进行验证； 2015年4月，撰写毕业论文。