沙氏鹿茸草实时荧光定量PCR内参基因的筛选开题报告

1. 研究目的与意义、国内外研究现状（文献综述）

1. 课题的意义

沙氏鹿茸草（monochasma savatierifranch. ex maxim）是玄参科鹿茸草属半寄生植物^[1]，主要分布在我国湖北，江西，福建等南方地区，其干燥全草鹿茸草具有清热解毒，凉血止血，祛风止痛等功效，是中药保护品种“炎宁颗粒”的主药材之一^[2]。

2. 研究的基本内容和问题

研究目标

旨在为研究沙氏鹿茸草的基因表达qrt-pcr分析提供参考。

研究内容

3. 研究的方法与方案

研究方法

为了筛选沙氏鹿茸草中稳定表达的内参基因，保证基因表达结果的可靠性，该研究以沙氏鹿茸草为材料，采用实时荧光定量pcr 技术对来自沙氏鹿茸草转录组数据的6 个内参基因（ubq, gapdh, ap-2, act, tub, cyp）在不同土壤含水量及接种丛枝菌根rhizophagusirregularis 条件下的表达水平进行检测，并结合genorm, normfinder 和bestkeeper 软件综合评价6 个内参基因的稳定性。

实验方案：

4. 研究创新点

目前沙氏鹿茸草内参基因的研究尚未见有报道，这不利于今后沙氏鹿茸草分子生物学的研究进展。本研究从沙氏鹿茸草转录组数据库中筛选了6个常用管家基因作为候选内参基因，通过GeNorm，NormFinder，Bestkeeper三种内参分析软件对6个基因进行不同土壤含水量及接种丛枝菌根条件下的稳定性表达分析。从分析结果来看，3种分析方法的结果趋于一致：TUB和GAPDH的分析结果比较接近且表达最稳定，而ACT得表达最不稳定。3种内参分析软件对AP-2，CYP，UBQ的表达分析略有不同，这可能是由于3种分析软件的处理数据的原理不同造成的，这种情况也出现在罗汉果，柑橘等物种的内参基因筛选过程中。

本研究筛选了不同土壤含水量及接种丛枝菌根条件下沙氏鹿茸草稳定表达的内参基因即TUB和GAPDH，为下一步沙氏鹿茸草基因功能研究奠定了基础。

5. 研究计划与进展

研究计划及预期进展

2019.03—2019.04搜集相关的资料，制定研究课题的方案；

2019.04—2019.05选取与实验相符合的种植材料进行栽培种植；